Ratchet & Clank: A Crack in Time

Continuando do fim de Quest for Booty, Clank foi sequestrado pelos Zoni para um lugar chamado o Grande Relógio em nome do robô Dr. Nefarious, que está tentando descobrir o segredo da instalação dele. Tentativas nefastas de acessar os bancos de memória de Clank para a chave de algo chamado Câmara de Orvus, mas não é permitido fazê-lo por causa do Zoni. Nefarious então liberta seu Hypersonic Brainwave Scrambler, fazendo com que o Zoni fuja e um apagão ocorra. Quando o poder é restaurado, Clank acordou e tenta escapar, mas é pego por Nefarious e seu mordomo, Lawrence e rapidamente imobilizado.
Clank acorda mais tarde para se encontrar com um robô chamado Sigmund, que é o Guardião Júnior da instalação, sem sinal de Nefarious e suas tropas. Através do uso de estações chamadas câmaras mnemônicas que tocam em seus bancos de memória, Clank descobre que o Grande Relógio foi construído pelo cientista Zoni Orvus como um meio de curar danos ao universo causados pelo uso excessivo de viagens no tempo. Uma parte de Orvus ainda reside nos bancos de memória de Clank, colocado lá quando Clank foi construído pelos Zoni para que um dia Clank seria capaz de tomar o manto de cuidador sênior, com a ajuda do Zoni. Clank também descobre que seu pai foi para um posto avançado em Zanifar e nunca mais voltou para o Relógio.
Enquanto isso, Ratchet e Qwark exploram o Sistema Breegus para obter informações sobre Clank e Nefarious. Eles aprendem de um "exílio" que também está lutando Nefarious, e rastrear o ser para baixo para outro Lombax, General Alister Azimuth. Ao explorar Krell Canyon para um Olho Obsidiana para falar com Clank, Azimuth diz a Ratchet que ele sabe de seus pais e que foi sua culpa que o Imperador Tachyon foi capaz de chegar ao poder, tendo compartilhado o gênio técnico dos Lombaxes com ele. Quando os Lombaxes partiram para outra dimensão, Azimute foi forçado a ficar para trás como punição por seus "crimes". Azimuth também conta a Ratchet sobre o Grande Relógio, e que eles podem ser capazes de usá-lo para trazer de volta os Lombaxes para este universo. Depois de falar com Clank através de um Olho Obsidiana e salvar Qwark de um grok de guerra chamado Snowball, Ratchet usa um portal do tempo em Zanifar para descobrir o que aconteceu com Orvus. Nefarious capturou os Zoni para tentar entrar na Câmara de Orvus, mas falhou depois que Orvus desapareceu no ar. Ratchet conseguiu escapar e salvar Azimuth do capanga de Nefarious, Lorde Vorselon. (Mas não antes de alterar a aparência de Nefarious, dando ao seu passado uma cicatriz permanente em seu olho direito)
Ratchet e Azimuth conseguem libertar Clank de outro grupo de capangas de Nefarious, as Valquírias. Clank então consegue convencer Ratchet que o plano de Azimuth para usar o Relógio inevitavelmente destruiria o universo, levando Azimuth a sair tristemente. Ratchet, Clank & Qwark em seguida, lançar uma missão furtiva a bordo da base de Nefarious, mas eventualmente são pegos. Antes de lançar Ratchet e Clank em um asteroide no espaço profundo, Nefarious revela que ele planeja usar o Grande Relógio para voltar no tempo para frustrar os vários heróis através do universo e criar um presente onde os vilões sempre reinam supremos. O asteroide de Ratchet e Clank cai em um planeta próximo (Planet Morklon), embora os dois estejam ilesos devido à proteção dos Zoni. Vêem que o mundo em que aterraram foi destruído. Um fongiod sobrevivente chamado Yurik reverenciou esta causa pelos agorianos há dez anos e contou a história da batalha de Gimlick Valley. Certo dia, os agorianos de repente atacaram a aldeia pacífica e capturaram muitos moradores de Fongiod. O líder da tribo e um exército de soldados foram reunidos para lutar, apenas para que o líder da tribo fosse morto e os agorianos destruíssem a barragem, destruindo a aldeia Fongoid. Eles usam um portal de tempo similar de Zanifar para resgatar os Fongoids dos últimos dez anos atrás para a batalha do vale de Gimlick. Eles entram em combate com Agorianos salvando Yurik que diz Ratchet para salvar os prisioneiros. Depois de libertar os prisioneiros com a ajuda dos Fongóides, eles confrontam o Comandante Argos, um general agoriano que estava pilotando sua nave. A dupla destrói o navio enquanto ele afunda na represa. Fongoids aplaudiu a vitória e, em seguida, a dupla voltou ao presente, onde eles vêem uma aldeia diferente mais pacífica do vale de Gimlick. Onde as duplas surpresa são gigantes sebes memorial da dupla e é o 10 ano de aniversário do dia em que a dupla salvar a aldeia Fongiod. A dupla encontra-se com um Fongiod que eles pedem emprestado o navio memorial que Argos usou durante a batalha que aparentemente foi recuperado e reparado desde que caiu na barragem. A dupla retorna a Nefarious para enfrentá-lo novamente antes que ele possa alcançar o Relógio. Eles são capazes de derrotá-lo a bordo de sua nave, mas Lawrence consegue escapar na cápsula de fuga enquanto a nave se afasta para a base de Nefarious. Assim como a nave está prestes a atacar, Azimuth chega para resgatar Ratchet e Clank. Enquanto a dupla corre em direção à nave de Azimuth, a nave de Nefarious bate nela e destrói a base.
O retorno do grupo